Известный государственный деятель граф Дмитрий Николаевич Блудов, изучая родословие рода Романовых, обнаружил несколько противоречащих друг другу фактов, в частности, какая из жен Никиты Романовича была матерью патриарха Филарета, и, как следствие, бабушкой первого царя из династии Романовых Михаила Федоровича. Свои сомнения он изложил в письме управляющему МГАМИД кн. М.А. Оболенскому, ссылаясь на хранящийся у него манускрипт из собрания известного коллекционера Коробанова. «В нем означены имена супруг боярина Никиты Романовича и тут же сказано было сначала, что от второй, Евдокии Александровны княжны Горбатой родился Феодор Никитич Романов, но потом г. Коробанов перечеркнул слова от нее и вместо их надписал на верху от первой. Между тем однако ж многие, и как мне кажется, достойные внимания обстоятельства, заставляют меня сомневаться, чтобы Феодор Никитич был или даже мог быть сыном первой супруги боярина Никиты Романовича, умершей в 1552 году». Сопоставив годы рождения детей Никиты Романовича, граф Блудов подтверждает мнение о рождении Филарета Никитича от второй жены Никиты Романовича, однако просит выявить в архиве неизвестные документы по этому вопросу.

В современной историографии матерью Федора Никитича считается первая жена Никиты Романовича Варвара Ивановна (ур. Ховрина).